Durante todo el año 2012 el Museo Histórico Regional de la Colonia San José recibió la cantidad de 20.800 personas, superando así a los visitantes del año anterior. La mayoría provienen de las provincias de Buenos Aires, Santa Fe , Córdoba y Entre Ríos.

Desde hace años el Museo es sede de prácticas educativas de la Carrera de Turismo de las Universidades de Morón, Universitas, La Suisse, Mariano Moreno, Palermo y UADER como así también es visitado por Directores y Rectores de colegios secundarios de Capital Federal, quienes luego lo recomiendan para sus alumnos .

Se destaca también el intercambio realizado con escuela de la República Oriental del Uruguay en el marco de la red de Museos Históricos que nuclea al Museo a Perpetuidad de Paysandú y nuestro Museo.